Nach dem Studium der Philosophie und Germanistik in Berlin war er Redakteur sozialdemokratischer Zeitungen, u. a. des "Vorwärts". Im Ersten Weltkrieg schloß er sich 1917 der Unabhängigen Sozialdemokratischen Partei Deutschlands an. Eisner proklamierte am 7. November 1918 die Republik Bayern und übernahm als Ministerpräsident eine Koalitionsregierung. Er wurde von Anton Graf von Arco-Valley ermordet. Sein Tod wurde zum Signal für die Ausrufung der Münchner Räterepublik. Eisner schrieb u. a. eine Biographie über Wilhelm Liebknecht (1900), "Zukunftsstaat der Junker" (1904) und "Das Ende des Reichs" (1907).