Gruner war ab 1801 im preußischen Staatsdienst, 1809 wurde er Polizeipräsident von Berlin. 1811 zum Chef der gesamten „Höhern (politischen) Polizei“ in Preußen ernannt, baute er ein wirksames System der preußischen Gegenspionage zur französischen Überwachung auf. Als Anhänger Steins zur Emigration nach Prag gezwungen, bemühte er sich um den Ausbau eines Nachrichtendienstes im Rücken der französischen Truppen. Wegen antinapoleonischer Aktivitäten von der österreichischen Polizei verhaftet, wurde er bis August 1813 auf der ungarischen Festung Peterwardein inhaftiert. Anschließend war er im Rahmen des Steinschen Zentralverwaltungsrates der von den Verbündeten eroberten Länder Generalgouverneur der Grafschaft Berg sowie 1814 des Mittelrhein in Trier. 1816 wurde er geadelt. Von 1816 bis zu seinem Tode war er preußischer Gesandter in Bern.