Er war Professor in Basel, Greifswald, München, Heidelberg und Leipzig und verfaßte das dreibändige "Lehrbuch des Pandektenrechts" (1862-1870), "Die Lehre des römischen Rechts von der Voraussetzung" (1850) und "Die Actio des römischen Zivilrechts" (1856). Windscheid war führender Vertreter der Pandektenkunde (Sammlungen altrömischer Rechtssprüche werden als Pandekten bezeichnet) und hatte als Mitglied der dazu berufenen Kommission Einfluß auf die Ausarbeitung des ersten Entwurfs eines deutschen bürgerlichen Gesetzbuches.