Er war Schüler des Joachimsthalschen Gymnasiums in Berlin. Durch den Besuch vieler Vorlesungen bildete er sich selbst wissenschaftlich weiter und erwarb chemische Kenntnisse. Er beschäftigte sich mit der Branntweinbrennerei und erfand den "Pistorius'schen Brennapparat". 1821 kaufte er das Rittergut Weißensee, machte es zu einem Mustergut, dehnte den Kartoffelanbau für die Branntweinproduktion aus und erweiterte den Viehbestand. Pistorius war viele Jahre Mitglied des Kreistages Niederbarmin. Er wurde auf dem Kirchhof bei der Dorfkirche Weißensee beigesetzt.